一、初創期（2003年—2006年）

2003年，南京市政府開展老市場搬遷規劃選址工作。

2006年，市政府最終確定市場選址江寧高橋門地區。該區域處于南京主城東南角，是南京通往上海、浙江、安徽以及我省蘇州、無錫、常州、鎮江等地區的交通樞紐，為農副產品的進出創造了極為有利的條件。

同年8月7日，江寧區政府決定與南京農貿中心共同組建南京農副產品物流配送中心有限公司。

2006年9月正式確立了公司的標識，標識是企業的象征與精神，是企業特點的集中表現，也是視覺識別系統的核心。

2006年12月18日，南京市發改委同意規劃用地3000畝，項目一次規劃分兩期建設。

二、建設期（2007年—2009年）

2007年1月，籌建了指揮部臨時辦公用房

2007年3月，在進行了長達一年的拆遷安置工作后，一期場地平整開工，進入實質性建設階段。

三、運行初期（2009年—2014年）

? ? ? ?2009年，南京白云亭、農貿中心、應天水產等七家農副產品批發市場按期遷入，蔬菜市場、果品市場、副食品市場交易區試營業。

2010年6月12日，經過一年試營業后，南京農副產品物流中心盛大開業！為期四天的江蘇名優農副產品推介產銷會也同期舉行。

2011年5月24日，農副物流中心成立黨總支，并于同年12月改為黨委。

2011年9月，農副物流榮獲“農業產業化國家重點龍頭企業”稱號。

2012年5月至10月，果品市場進口水果和精品水果D區以及酒店用品市場正式開業。

2013年，“眾彩”商標先后被市、省工商行政管理局評為市級、省級著名商標。?

四、智慧眾彩打造期（2015年—）

2016年6月，國家商務部公布首批全國公益性農產品示范市場名單，農副物流成為江蘇唯一一家公益性農產品示范市場。

2017年8月，農副物流榮獲“江蘇省對口支援青海省有功單位”榮譽稱號。

2019年3月，農民日報發布2017年度農業產業化龍頭企業500強排行榜單，農副物流以農產品年交易額505億元的規模，首次進入“中國農業產業化龍頭企業500強”前10名，這也是江蘇本土農業產業化龍頭企業首次進入榜單10強。

2019年10月23日下午，市民中心劇場隆重舉辦了慶祝中華人民共和國成立70周年暨南京農副產品物流中心開業10周年職工文藝匯演。

十年來，眾彩累計實現交易額超過3300億元 ，累計實現交易量突破8000萬噸，年均增幅超過16%，先后榮獲國家級榮譽超過30項，榮獲省市級榮譽超過100項，完成冬季保供蔬菜累計超過20萬噸，累計檢測農副產品超過300萬批次，累計接待國內外考察團超2000批次，品牌價值突破40億元